【2026年版】中小企業向け給与計算ソフト比較7選|クラウド型・年末調整対応で選ぶ

人事・給与

※ 本記事は 2026年5月 時点の情報に基づきます。料金・機能は変動するため、最新情報は各サービス公式サイトをご確認ください。本記事には広告(アフィリエイトリンク)を含む場合があります。

こんな方におすすめの記事です

給与計算の手作業から脱却し、年末調整・社保算定基礎届・住民税まで一元化したい中小企業向けに、クラウド給与計算ソフトの選び方とおすすめ7サービスを比較します。

  • 給与計算をExcelや古い給与ソフトで行っており、年末調整がボトルネックになっている方
  • 社労士に外注しているが、コストや内製化を検討中の方
  • クラウドへの移行で在宅勤務時の給与処理を可能にしたい方
  • 法改正(電子帳簿保存法・インボイス制度・社保改定)への対応に追われたくない方

クラウド給与計算ソフトを選ぶときの5つのポイント

クラウド給与計算ソフトを選ぶ際は、勤怠管理との連携・年末調整対応・社労士連携を中心に検討するとミスマッチが減ります。

  1. 勤怠管理との連携: 打刻データを取り込んで自動計算できるか、ファイル連携かAPI連携か
  2. 年末調整・法定調書のWeb完結: 従業員からの申告書回収・電子提出までソフト内で完結できるか
  3. 社保・所得税・住民税の自動更新: 料率・税額表の改定をベンダーが自動反映するか
  4. 社労士との連携: 顧問社労士が同じ画面でレビュー・承認できるか
  5. マイナンバー管理: マイナンバー収集・暗号化保管・退職時自動削除など、セキュリティ要件を満たすか

【一覧比較】中小企業向けクラウド給与計算ソフトおすすめ7選

本記事で取り上げる7つのクラウド給与計算ソフトを一覧で比較します。詳細は下の各製品紹介をご覧ください。

サービス名月額(税抜)推奨規模特徴
freee人事労務2,380円〜/月+人数10〜200名労務オールインワン
マネーフォワード クラウド給与2,980円〜/月+人数10〜300名MF会計とAPI連携
弥生給与 Next要問合せ10〜100名実績とサポート
ジョブカン給与計算400円〜/人5〜100名勤怠とセットで割安
PCA給与DX クラウド要問合せ50〜500名複雑給与に強い
スマレジ・タイムカード給与要問合せ店舗系多店舗・現場系
ロウム・メイト クラウド要問合せ10〜200名社労士併用に最適

各クラウド給与計算ソフトの詳細紹介

freee人事労務

労務全般をワンストップ

勤怠・給与・年末調整・社保・労務手続きまで1サービスで完結。バックオフィス全体をfreeeで揃える企業に最適。

  • 料金: 2,380円/月〜+人数課金
  • 主な機能: 年末調整Web申告、社労士共同編集、勤怠連携
  • おすすめの企業規模: 10〜200名のクラウド志向企業

マネーフォワード クラウド給与

会計と一体管理

MF会計を使う企業の標準解。年末調整・住民税更新・電子申請まで対応し、社労士向け機能も充実。

  • 料金: 2,980円/月〜+人数課金
  • 主な機能: 勤怠・社保・年末調整Web対応、API連携豊富
  • おすすめの企業規模: 10〜300名のMF利用企業

弥生給与 Next

実績豊富で社労士連携も手厚い

長年の実績がある弥生のクラウド版。サポート品質と社労士ネットワークの広さに強み。

  • 料金: プラン要見積(年間契約)
  • 主な機能: 年末調整Web申告・社保・電子申請・サポート手厚い
  • おすすめの企業規模: 10〜100名で安定運用したい企業

ジョブカン給与計算

勤怠と一体で低価格

同社勤怠管理と組み合わせるとコスパ抜群。シリーズ統一で運用シンプル。

  • 料金: 400円/人・月〜
  • 主な機能: 勤怠連携、年末調整、明細Web配布
  • おすすめの企業規模: 5〜100名のジョブカン利用企業

PCA給与DX クラウド

中堅企業の堅実な選択

パッケージ時代から続くPCAブランドのクラウド版。複雑な給与体系・ジョブ給にも強い。

  • 料金: 要見積(中堅向け)
  • 主な機能: 複雑な給与計算、退職金、賞与計算
  • おすすめの企業規模: 50〜500名の中堅企業

スマレジ・タイムカード給与

店舗・現場運用に強い

スマレジと連携して現場の勤怠・給与をワンセットで運用できる。多店舗展開に有効。

  • 料金: 要見積
  • 主な機能: 多店舗管理、シフト連携、給与明細Web
  • おすすめの企業規模: 店舗チェーン・小売・飲食

ロウム・メイト クラウド

社労士併用で安心

社労士事務所と顧問契約しながら、クラウドでデータを共有して内製と外注のハイブリッド運用が可能。

  • 料金: 要見積
  • 主な機能: 社労士共同編集、電子申請、給与明細
  • おすすめの企業規模: 社労士活用企業

業種別・規模別おすすめパターン

バックオフィスをまるごとクラウド化したい場合は freee人事労務 か マネーフォワードクラウド給与、社労士との連携を重視するなら 弥生給与Next または ロウム・メイト、勤怠と一体で低価格に始めたいなら ジョブカン給与計算、店舗系なら スマレジ・タイムカード給与 が有力です。

よくある質問(FAQ)

Q1. 年末調整は本当にWebで完結しますか?

紹介した主要ソフトは、従業員から申告書をWebで回収→システムが自動計算→源泉徴収票・支払調書を電子発行までWebで完結できます。紙運用が完全に不要になるケースが大半です。

Q2. 社労士に依頼している業務との両立は可能ですか?

多くのソフトは社労士向けの共有閲覧・承認機能を提供しており、社労士に「マスタ管理だけ依頼」「給与計算は内製、社保手続きだけ依頼」といった分担が可能です。

Q3. マイナンバーの取扱いはどうなりますか?

各サービスとも暗号化保管・アクセスログ取得・退職時自動マスキング等、マイナンバー法ガイドラインに沿った取扱いを行っています。

Q4. 移行はどれくらい大変ですか?

過去データの移行(従業員マスタ・給与履歴)は1〜3ヶ月かかります。年末調整完了後の翌1月スタートが最もスムーズです。

まとめ

うちの店で給与計算をクラウド化したのは2年前のこと。それまでは紙の給与明細を月末徹夜で印刷して、封筒に詰めて、店舗ごとに配って…という地獄の作業をやってました。クラウドにしてから何が一番変わったか?ぶっちゃけ「年末調整の地獄から解放されたこと」、これに尽きます。スタッフへの源泉徴収票はWebで配って、税務署には電子申告でポチッ。最初こそ「紙もらえないんですか?」とぼやくスタッフもいましたが、慣れたら「便利」って言葉に変わりました。中小企業なら freee人事労務 か マネーフォワード人事労務、社労士さんに頼んでる方は 弥生給与Next か ジョブカン給与計算 が王道。まずは無料トライアルで給与計算1ヶ月分を実際に走らせ、自社の給与体系(歩合・夜勤手当・深夜割増など)が乗るかを確認してから決めてください。安いツールに乗り換えて運用が地獄になるくらいなら、ちょっと高くても自社運用に合うほうが結果的に安上がりですよ。

本記事は今後のアップデートで料金・機能変更を反映していきます。最終更新日: 2026年5月

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兵庫県神戸市出身。ラーメンチェーンで7年勤務した後、28歳で独立し自家製麺ラーメン店を経営(8年)。36歳で業態転換し、現在は東京都内に居酒屋3店舗を運営する飲食店経営者(48歳)。社員5名+アルバイト40名を束ねながら、シフト管理・パート/アルバイトの労務・最低賃金対応・36協定・採用と定着など、現場の労務課題に日々向き合っている。本サイトでは「勤怠・労務」「人事・給与」のカテゴリを担当。

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